深水泵和潜水泵在性能上具有很多相似之处，但也存在一些区别。首先从用途上来区别，深水泵主要是用来在深水中实施水文测量，抽样，或清理水水体中物质的仪器，它能够在深达300m的水深中工作；而潜水泵主要是用于水下潜水活动，它可以将水抽到上面的深水处，将水从深水抽出，打破原有的水流，达到浑水提浓的目的。
其次是来自材料的区别，深水泵的外壳通常采用铝合金或其他金属，可以很好地抗剪力和高水压的损坏，而潜水泵则以塑料为主，易于抗冲击的能力很强。最后是关于电极的不同，深水泵的电极可以承受高压力和高温，潜水泵的电极由于材质的不同，则只能用于低温下，所以，在使用潜水泵的时候，应注意不要浸入高温的水水中。
综上所述，深水泵和潜水泵在用途、材质和电极等方面都有许多区别，所以在实际应用中也要做出相应的区分。
